La cabecera municipal de San Mateo Ixtatán se encuentra ubicada en una pendiente, parte de la sierra de Los Cuchumnatanes, su localización geográfica es: latitud norte 15° 49’ 45’’ y longitud oeste 91° 28’ 2’’, a una altitud de 2, 540 metros sobre el nivel del mar. Dentro de la regionalización de Guatemala está ubicado en la región Vll conformados por los departamentos de Quiché y Huehuetenango, departamentos ubicados en la zona nor-occidental de la república de Guatemala, y San Mateo Ixtatán se encuentra ubicado en la zona norte del departamento de Huehuetenango, formando parte de los 31 municipios del departamento. Es uno de los municipios más grandes del departamento.